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13세기에 시작된 학문적 가르침은 대학이 주도하였다. 이러한 움직임은 13세기에 여러번 일어났고, 대학은 사회/정치/학문에 ㅁ낳은 영향을 미쳤다. 대부분의 대학에서 의과대학이 생겨났고, 많은 해부학 강의가 시작되었다. 대학의 교육환경은 스콜라 학파가 주류를 이루어 전반적으로 무거운 분위기를 이루었다. 12~13세기의 대학은 자연과학을 멸시하였으며 해부학 실습조차 시행되지 않았다. 공시적이거나 비공식적으로 사람 해부실습에 대한 첫 증거는 1300년 무렵, 볼로냐에서 찾을 수 있다. 볼로냐대학은 아주 오래되었고, 대학이라는 말을 사용할 수 있는 가장 오래된 학교이다.
볼로냐대학은 역사적으로 최초의 법학 대학이고, 13세기 중반 이후에도 법률분야의 교육기관으로 유럽에서 가장 명성이 높았다.
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